为了进一步深入阐明外星人较人类极其退化的生理结构形成的原因，说明地球人类生理结构、功能在未来的发展趋势，我引入新的学说和新的概念研究这两个问题。


首先，我们把人类或外星人未进行超功能开发前的系统、器官叫做初级系统、初级器官；开发出超功能后生理结构退化了的系统、器官，叫做退化系统、退化器官。


人类等智能生命通过科学研究及科学实践，认识到自身的超功能（即人体潜功能），并寻找到科学的方法如气功、瑜珈术等开发自身潜能。开发出高级的超功能后，进化了的功能便会替代初级系统。初级器官所担负的生理功能，从而使得初级系统、初级器官不用而退化，形成退化了的退化系统、退化器官，这些进化了的功能和退化了的器官、系统的性状能够遗传下去。


因而，人类等智能生命用气功、瑜珈术等身心修练术开发自身潜能，开发出的进化了的超功能便会替代初级系统、初级器官所担负的低级功能，使得初级系统、器官因不用而退化，逐渐形成退化系统、退化器官，并且进化的功能与退化的器官、系统的性状能够遗传。我们称这种能合理地解释外星人相对人类极退化的生理器官、生理系统且能描述人类超功能开发后生理结构发展趋势的学说，叫做替代—废退理论。它主要过程表现为： 智能进化 （潜）功能开发→功能进化→功能替代→器官不用→器官退化，其重点表现为：（潜）功能进化→（初级）器官退化。我们称智能生命在进化过程中表现出的功能开发、功能进化、功能替代、器官不用退化的作用，叫做替代—废退作用。


我们把智能生命替代—废退过程中的初级系统、初级器官退化现象分为五种：突变退化、渐变退化、协调退化、同步退化、孤立退化。


根据退化过程的快慢，我们分为渐变退化和突变退化。智能生命进—退化过程中退化比较缓慢的退化，叫做渐变退化，相对的，退化比较迅速的退化叫做突变退化。如人类或外星人辟谷长期不食后引起消化系统部分器官迅速退化，即是突变退化。


根据退化与相关系统、器官的联系我们分为协调退化、同步退化、孤立退化。我们把与相邻系统有联系的退化叫做协调退化；智能生命同一系统内相关器官的有联系的退化，叫做同步退化；与相邻的系统、器官缺乏联系的退化，叫做孤立退化。


智能生命替代—废退过程中，由智能生命体整体（多个系统）担负的功能，叫做总体功能；由智能生命体单个系统或单个器官所担负的功能叫做系统功能或器官功能。由外星人生理结构资料分析可明显看出：开发出超功能的智能生命体的进化过程，是一个总体功能不断强化进化的过程，同时又是它的系统功能、器官功能进一步弱化、退化的过程。